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羊肚菌养菌期间，每2~3天检查一遍，及时发现，及时采取措施，避免扩散性。
羊肚菌杂菌可能有以下原因：
1、重茬。经过2年以上的种植，土壤里面存在大量杂菌，很容易导致杂菌大面积，有些区域甚至因为连作导致绝收。
2、田地腐殖质含量过多，或添加未腐熟的有机肥，容易滋生杂菌。
3、菌丝活力弱。羊肚菌菌丝活力弱，进袋能力不足，杂菌就会乘虚而入，营养袋。
解决办法：
1、制定合理的生产方案，避免高温环境下播种。高温条件下，菌种活力降低、菌丝纤细，杂菌活跃度高，杂菌同时还会侵袭菌种。这样一方面羊肚菌处于劣势状态、而杂菌在高温下优势活跃的，杂菌就将快速繁衍，后期很难控制。因此，制定合理的生产方案尤为重要。
2、田地预处理。通过高温暴晒、作物轮作、生石灰消杀的措施，将环境中的有害微生物降低到无害状态。连作的土地需经过彻底的、杀虫处理，消灭、性病害及虫卵、地下害虫等虫害。
3、外源营养袋保障营养配方合理、彻底，并及时摆放。
4、外源营养袋摆放到出菇之前，如发生大比例的外袋污染，必须在出菇前进行撤袋，可选择出菇前5-10天期间撤袋，并对外袋摆放位置明显有杂菌外溢的地方施撒生石灰，进行消杀。
益富源菌菇益生宝由光合、乳酸菌、芽孢杆菌、酵母菌、放线菌等多种有益菌经特殊工艺研制而成的复合微生物菌液。每毫升含有益活菌数≥200亿以上。
益富源菌菇益生宝的功能作用
1、分解大分子营养物质 分解培养料中纤维素等大分子物质成分，降解成易被吸收利用的糖、氨基酸等有机物，并优化基料的团粒结构，提高其透气性能和保水性能。
2、固定空气中的氮，增加培养料的营养 供菌丝和子实体吸收利用，同时还具有解磷、解钾的作用，使无效态P、K转化成有效态。
3、补充营养，促进菌丝扭结和子实体生长发育（子实体表成过程中，需要多种有益微生物的共同作用，才能提高出菇与产量）。
4、拌料 拮抗有害微生物，抑制有害菌增殖，起到防病效果，提高培养料利用率、发菌率。
5、增产增收，改善口感 能够有效缩短培养料发酵时间，提高发酵质量，增加养分，促进菌丝生长，改善菇类口感，提前出菇，延长保鲜期。
